El Real Madrid inició una campaña llamada «Juntos podemos» en la que pedía el apoyo de su afición, y comenzó a referirse al campeonato como «la Liga del clavo ardiendo», psg camiseta al ser su última oportunidad para lograr un título en esta temporada. Esta fue impulsada por el periódico deportivo francés L’Équipe de mano de su director en la época Gabriel Hanot junto con su colega Jacques Ferran, y con el apoyo del presidente del Real Madrid, Santiago Bernabéu, así como Gusztáv Sebes, subsecretario de deportes de Hungría y vicepresidente de la UEFA. ↑ Getafe se clasificó para primera ronda de la Copa de la UEFA 2007-08, ya que el campeón de la Copa del Rey 2006-07 (Sevilla) se clasificó a la tercera ronda previa de la Liga de Campeones de la UEFA. Pero el final fue feliz para los sevillistas: ganaron las finales de la Copa de la UEFA, disputada en Glasgow ante el Espanyol (2-2) por penaltis, y la Copa del Rey, ante el Getafe en el Santiago Bernabéu por 1-0, gol de Kanouté. Abbondanzieri, guardameta internacional de Argentina, consiguió el trofeo al portero menos goleado en su debut en liga española, siendo también la primera vez que un jugador del Getafe CF conseguía el reconocimiento.
Dicha norma se mantuvo vigente hasta la temporada 2007-08, en donde los equipos que se proclamaban campeones sin lograr completar el ciclo debían devolver el trofeo dos meses antes de la final del año siguiente, entregándoseles a cambio una réplica a escala menor. Desde la temporada 1999-2000 hasta la 2023-24 participaron 32 equipos en la competición, que se organizaban en una primera ronda que se juega en forma de liguilla. El encuentro acabó 3-3, con el Real Madrid adelantándose siempre en el marcador y el Barcelona igualando cada vez, empatando Messi de forma agónica en el descuento. Este primer encuentro terminó ganando 3-1. Durante sus primeros años ya era un segundo partido que generaba pasiones en la ciudad quiteña, pero no fue hasta 1969 que se lo catalogó como clásico universitario. La defensa azulgrana era solvente: excepto en una derrota por 3-1 contra el Espanyol, no recibió más de un gol por partido durante 15 jornadas, y Víctor Valdés se estableció como un especialista en parar penaltis. La clasificación final se estableció con arreglo a los puntos obtenidos en cada enfrentamiento, a razón de tres por partido ganado, uno por empatado y ninguno en caso de derrota.
Pasadas las primeras jornadas de la Liga, el Barcelona se situaba en el liderato, ganando sus partidos, aunque sin la facilidad y el espectáculo exhibidos en 2004 y 2005. Y fallando ante sus rivales: empate ante el Valencia y derrota en el Bernabéu por 2-0, goles de Raúl y Van Nistelrooy. En el minuto 89 el Barcelona ganaba 2-1 al Espanyol y el Real Madrid perdía por el mismo resultado en La Romareda ante el Real Zaragoza. A falta de dos minutos para finalizar los dos partidos, que se jugaban a la misma hora, el Barça ganaba por 2-1 tras el árbitro validar un gol ilegal con la mano de Messi y el Madrid perdía ante el Zaragoza por idéntico resultado. El invierno fue difícil para el Madrid: cayó del segundo al cuarto puesto tras una mala racha de 4 victorias, 4 empates y 5 derrotas, incluyendo una goleada en casa (0-3) ante el modesto Recreativo de Huelva, la sorpresa del año. Tuvo opciones de alcanzar a los líderes hasta que perdió un partido clave en el Bernabéu ante el Real Madrid (2-1) a falta de siete jornadas para el final.
En la jornada 35, el Real Madrid ganó de forma agónica en Huelva (2-3) con un trallazo de Roberto Carlos, su último gol como madridista. De forma ideal, el tiro debería ir dirigido a la escuadra, pero es menos difícil y también efectivo hacerlo a ras de suelo. La Primera División de España 2006/07 fue organizada por la Liga Nacional de Fútbol Profesional (LFP). Un total de 24 colegiados arbitraron los partidos de la Primera División de España 2006/07. Debutaron en la categorías Álvarez Izquierdo, Clos Gómez y Delgado Ferreiro. Distinta era la situación en Italia, donde un escándalo de compra de partidos acabó con severas sanciones, incluyendo el descenso administrativo de la Juventus de Turín, lo que conllevó que sus estrellas dejaran el club, algunas de ellas para probar suerte en España. Gianluca Zambrotta y Lilian Thuram desde la Juventus. Dejaba escapar puntos en casa, pero a domicilio era infalible, especialmente gracias al olfato goleador de Van Nistelrooy. Por segundo año consecutivo el asturiano David Villa logró el premio otorgado por el Diario Marca al máximo goleador español.